到了后来，医院行政大楼遭到了叛军的袭击，而且那个时候屠教授也在医院的行政大楼里，所以屠教授的安全也受到了威胁。当时武警二大队的队长和教导员商议之后，一致决定出兵支援。于是他们按照程序向总部请示，并说明了事情的原委，包括屠教授遇险等都做了汇报。

但是总部的回答非常的简单，仅仅只有两个字“不准”！因为迫于总部的压力，所以二大队没有做出任何的动作。

但是随着事态的发展，叛军居然派出了武装直升机和狙击手封锁了天台。一度让驻军和屠教授的安危受到进一步的威胁。当时二队的队长和教导员再次请求出兵支援，可是依然被拒绝。同时还加了一条理由：袭击者着装和你们一致，贸然出兵必然引发误伤！

之后总部还专门把二大队的教导员单独留下，狠狠的批斗了一番，说他身为负责队伍建设，主管队伍组织纪律的军官，对于部队官兵不愿意遵守军纪，屡次请愿欲违反军令的行为非但不予以劝阻，反而参与其中，是典型的无组织无纪律行为。还给了二大队的教导员记过处分。当教导员被训斥之后，出来对二大队的队长和士兵们说地第一句话就是“军人嘛，以服从命令为天职”。

但是二大队的所有人的可以看得出来，教导员那个时候并没有因为批斗和处分而后悔，反而因为没能出兵而愧疚。但是正如教导员说的那样，军人是以服从命令为天职的。所以此后一段时间，没人再提出兵一事，但是大家还是通过监控设备实时了解着行政大楼和医院里的情况。

幸运的是，屠教授和驻军部队最终击败了叛军。守住了行政大楼。此后，屠教授为此还专门来到了地下实验室，直接以新都事件副总指挥的名义询问总部，为什么不允许地下实验室出兵支援一事。结果不但没有问出个所以然来，就连屠教授自己都被狠狠训斥了一番。

而且总部还单独给屠教授下达了一些指令，但是指令的具体内容嘛，大彪就不知道了。而且武警三位中队长也不知道。听说当时知道的除了屠教授本人之外，只有武警队的队长和教导员两人。

再后来，叛军发动了新一轮袭击，也就是唐亮带队的那一次。但是二大队的人此时并不知道唐亮牵扯其中。因为这一轮袭击发动的同时，整个行政大楼内部的监控系统都出现了短时间的失控，地下实验室的监控设备无法连接到行政大楼的监控系统。直到整个事件结束，监控系统才逐渐得以修复。

而正是因为无法连接到行政大楼里面的情况，所以二大队的人并不知道这次袭击居然是一大队的教导员唐亮亲自组织策划的。而且也正是因为看不到医院和行政大楼里的实时情况，才会让二大队的人更加担心屠教授和驻军部队的安安危。